ООО "ИННОЛ"

Воздействие пробиотической очистки на микробиотическую экосистему больничных поверхностей 5 часть

После одного месяца применения системы PCHS число всех R‑генов, первоначально выявленных на момент T0, значительно уменьшилось, о чем свидетельствует сравнительный нормализованный анализ двух проб окружающий среды (рис. 6). Вместе с тем наблюдалось значительное, примерно трехкратное (в логарифмических показателях) уменьшение количества гена, идентифицирующего S. aureus, и spa гена по сравнению с контрольными показателями на момент T0. Данные на последующие моменты отбора проб T2, T3 и T4 подтвердили результаты, полученные по истечении первого месяца (T1) (S2 Fig, SFig и SFig): по сравнению с моментом T0 число индивидуальных генов почти во всех случаях уменьшилось, хотя и в разной степени в зависимости от рассматриваемого гена (табл. 2). Единственным исключением был ген msrA, количество которого несколько увеличилось во все протестированные моменты времени по сравнению с T0. Этот результат был ожидаемым ввиду природной хромосомной устойчивости к MSRA у видов PCHS-бацилл.

 

Резистом популяции на момент T1

Ось X: Гены устойчивости

Ось Y: log10 Кратность изменения (T1 по сравнению с T0)

 

Рис. 6. Профиль генов устойчивости к противомикробным веществам микробной популяции, заражающей больничные поверхности, после обработки по системе PCHS. ДНК, выделенную из общей заражающей микробной популяции, обрабатывали с помощью микроматрицы кПЦР, чтобы выявить присутствие 84 генов устойчивости (R‑генов) к антибиотикам. Результаты выражены как кратность изменения числа генных копий, рассчитанная путем сравнения значений, выявленных на момент T1, т.е. через один месяц после начала обработки по системе PCHS, с соответствующими значениями на момент T0 (до начала такой обработки). Результаты были нормированы на количество бактериальных клеток. Сходные результаты были получены для всех остальных протестированных моментов времени (SFig, S3 Fig и S4 Fig).

doi:10.1371/journal.pone.0148857.g006

 

Параллельно мы хотели убедиться, что штаммы PCHS-бацилл, высеянные на обработанные поверхности, не приобретают новых генов устойчивости. Для этого 20 изолятов бацилл, собранных с больничных поверхностей на каждый момент отбора проб, идентифицировали на уровне последовательности ДНК (используя два ПЦР с последующим секвенированием ДНК) и тестировали с помощью микрочипа для R‑генов; результаты этого анализа сравнивали с результатами, полученными для ДНК PCHS-бацилл, выделенных из состава исходного моющего средства. Результаты показали, что ни один из протестированных изолятов бацилл не приобрел R‑генов (рис. 7), т.е. явление переноса генов у этих бактерий отсутствует, что подтверждает аналогичные данные, полученные ранее [24]. Эти результаты были также подтверждены обычно используемыми антибиограммами изолятов бацилл, с помощью которых было проанализировано 42 разных антибиотика; антибиограммы показали отсутствие лекарственной устойчивости, отличной от той, которая наблюдалась у исходных PCHS-бацилл (данные не представлены).

 

Таблица 2. Воздействие очистки на основе бацилл на гены антибиотической устойчивости микробиоты, заражающей больничные поверхности

Ген устойчивости

На момент отбора проб по сравнению с T0*

T1

T2

T3

T4

AAC(6)-Ib-cr

-3,39

-2,11

-5,74

-3,55

IMI & NMC-A

-2,98

-7,94

-5,17

-5,17

SHV(156D)

-2,00

-4,19

-2,72

-2,74

SHV(156G)

-2,00

-4,19

-2,72

-2,74

SHV(238G240E)

-2,00

-4,19

-2,72

-2,74

SHV(238G240K)

-2,00

-4,19

-2,72

-2,74

SHV(238S240E)

-2,00

-4,19

-2,72

-2,74

SHV(238S240K)

-2,00

-4,19

-2,72

-2,74

ccrA

-3,21

-8,56

-5,56

-5,57

VIM-1 group

-5,68

-15,27

-10,24

-9,95

VIM-13

-3,73

-10,40

-6,76

-6,77

MOX

-2,28

-6,06

-3,94

-3,95

Группа OXA-50

-3,42

-8,79

-5,99

-6,00

Группа OXA-51

-2,00

-2,85

-3,07

-3,03

ermA

-5,22

-111,84

-8,94

-8,32

ermB

-7,92

-4,09

-120,19

-20,10

ermC

-4,34

-16,44

-1,82

-13,06



Размещено: 01.12.2017. Осталось - 360 дней.

Просмотров: 178